六朝研究所成立于2013年，是南京晓庄学院重点研究机构。六朝研究是历史学（师范）专业的传统优势研究领域，曾经涌现出江苏省六朝史研究会会长邱敏教授这样的史学名家。研究所成立以来，取得了一系列重要研究成果，在各权威期刊上发表论文数十篇，并出版了诸多学术专著，获得省部级奖项；获批国家社科基金项目5项，省部级项目6项。2017年，成功举办“六朝历史与南京记忆”国际学术研讨会。六朝研究所为推动六朝研究的深入发展和弘扬中华优秀传统文化做出了重要贡献。未来，研究所将砥砺奋进，争取在六朝研究领域取得更多突破，从而为历史教育贡献更多力量，为国家治理现代化提供更多历史镜鉴。